自己負担金額は契約の途中で変更できますか?

変更できません。

もし異なる自己負担金額をお望みの場合、一度解約して契約し直してください。

なお、一度解約して再契約した場合、新規契約扱いとなりますので、初回契約期間となる3ヶ月間は保険料が割引されません。